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目的:诊断1例患有原发闭经和单侧混合生殖细胞瘤的46,XY女性患者的遗传病因,该患者双亲均不具有该病的任何临床特征。
方法:本研究通过目标区域捕获和基于新一代测序的平台分析,对先证者及其父母进行基因检测.目标区域包括300多个DSD相关的基因的外显子及及内含子邻近区域,共1.5Mbp.为验证NGS获得的结果,对患者及父母进行了候选突变的Sanger测序.
结果:在46,XY CGD相关的8个基因上,该患者中检出26个变异。过滤掉UTR、内含子上的突变及同义突变后,剩下5个突变。由于46, XY完全性腺发育不全的发病率是1: 20,000,因此在千人基因组数据库中频率)0.01的突变可以排除。最后,检出位于SRY基因WMG域的编码区230位的一个单核苷酸的插入突变,即(c.230es 231insA),该突变导致截短蛋白(p.Lys77fsX27)。该突变位于Y染色体的2655414位,有127个read:支持,在1092名对照人群的内部数据库中没有检出该突变。该突变没有在患者父亲检出,表明该突变是一个denovo突变。为了进一步验证该突变,在患者及患者的父亲和弟弟中进行了Sanger测序验证,结果与目标区域捕获测序结果一致,患者表型正常的弟弟该位点为野生型。所有结果表明SRY基因上的新发突变很可能是导致该46,XY CGD的原因。
结论:对于高度遗传异质性疾病,新一代测序技术结合目标区域捕获技术是诊断该类疾病致病因素的最有效的途径。