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根据2008年8月15日至9月15日在吕宋海峡三个断面获得的0～200m层浮游植物数据,探讨分析了群落结构及其与不同理化性质水团的关系.结果表明共鉴定浮游植物4门61属169种(包括变种、变型和未定种),其中甲藻和硅藻物种数基本相当,都几乎占所有物种数的50％；另有金藻门3属3种；蓝藻门1种.优势种为卡氏前沟藻(Amphisdinium carterae)、锥状施克里普藻(Scrippsiella trochoidea)、角毛藻(Chaetoceros sp.).各层次浮游植物的丰度范围是(0.08～9.48)×106个·m-3,平均为1.448×106个·m-3.聚类分析结果表明浮游植物基本可划分为东部、中部、西部三个类群.