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穿山龙植物根进行的特定发育过程在药用次生代谢物——薯蓣皂甙生物合成和累积中发挥重要作用。为从穿山龙根中分离出薯蓣皂甙生物合成相关基因,利用抑制性消减杂交(SSH)和SMART技术,构建了3年生和1年生穿山龙(Dioscorea nipponica)根组织mRNA群体间正向差减cDNA文库。
从该文库中随机挑选了34个cDNA克隆进行酶切、测序,序列同源性比较。结果表明:其中25个cDNA克隆代表了新的EST序列。对其中6个克隆在3年生根组织的表达进行了半定量PCR和定量PCR分析,分别命名为DNR1、DNR2、DNR3、DNR4、DNR5和DNR6,其GenBank登录号分别为DN792551、DN792555、DN792562、DN792564、DN792565和DN792577。结果表明在不同的发育阶段其表达量具有差异,为根发育阶段筹异性表达基因。这也可能意味着其在薯蓣皂甙次生代谢合成可能起重要作用。该研究结果为克隆其全长基因和进一步研究其在薯蓣皂甙次生代谢生物合成中的功能提供了重要的实验基础。