新型冠状病毒在全球的爆发流行目前已造成上亿人感染和200多万人死亡。尽管已有多个国家正在开展疫苗接种,但是随着病毒的快速变异可能导致目前上市的疫苗保护效果不理想。先前德国格雷夫斯瓦尔德大学医学院GuglielmoLucchese教授比较了新型冠状病毒和人的蛋白组,发现了107个新型冠状病毒Spike蛋白特有的五肽,在免疫表位数据库（Immune Epitope Database,IEDB）中检索后发现有66个抗原表位包含这些特有的五肽,而这些表位大部分来自SARS病毒的Spike蛋白。鉴于新型冠状病毒和SARS病毒较高的同源性,这66表位所在的序列位置也可能是新型冠状病毒的有效抗原表位。因此,本研究将这66个表位所在的序列位置对应到新型冠状病毒Spike蛋白上,获得了新型冠状病毒的66个候选表位。通过对来自34个国家的1218株新型冠状病毒分离株Spike蛋白的单核苷酸多肽性分析,找到了该蛋白上52个易突变位点。分析这66个候选表位中含有易突变位点的情况,并对这些表位进行免疫原性、毒性、致敏性、刺激细胞因子分泌、溶剂可及性、是否属于B细胞和T细胞表达以及在不同人群中的覆盖率均进行了分析预测,筛选出最佳疫苗候选表位。通过计算机模拟最佳表位与不同连接肽连接获得疫苗候选蛋白,预测疫苗候选蛋白的氨基酸组成、二级结构、溶剂可及性、半衰期和稳定性等,最终筛选出最优疫苗蛋白序列。结果显示共筛选出16个疫苗候选表位,这些表位相对保守、有免疫原性、无毒性、无致敏性、能诱导细胞因子分泌、暴露在Spike蛋白表面的可能性较大、均属于B细胞和T细胞表位、能识别一定数量的HLA亚类分子、并且在不同人群中有较高的覆盖率。此外,预测出的897-913表位可能对新型冠状病毒和SARS病毒具有交叉免疫保护作用。疫苗候选蛋白筛选结果表明,这16个表位分别采用连接肽EAAAK、GPGPG、KK均有较好效果,获得的候选蛋白相对稳定,并且具有较高的抗原指数。本研究将为新型冠状病毒疫苗的研制提供候选表位和候选蛋白序列。