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有大量序列只在物种中的一个或者少数一些个体中存在,并不是每个个体都必需的,这些序列构成了物种的“非必需基因组(dispensable genome)”。非必需基因组与核心基因组(core genome,或称“必需基因组”)一起构成物种的泛基因组(pan-genome)。非必需基因组与个体间的表型变异和物种基因组进化等有密切关系,却往往由于不存在于参考基因组中而在研究中被遗漏。我们基于1483份水稻材料的低覆盖度基因组测序数据,使用类似微生物宏基因组(meta-genome)研究中采用的组装策略探索了水稻的非必需基因组。