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TonB转运系统则是革兰氏阴性菌普遍具有的一套转运系统,最早发现于大肠杆菌中.该系统由锚定在内膜的ExbB-ExbD和周质蛋白TonB组成,它为TonB依赖性外膜转运体(TonB-dependent transporter,TBDTs)提供能量,使其转运营养物质.TonB系统普遍参与了铁、血红素、维生素B12、碳水化合物及过渡金属元素等多种重要物质的转运过程.这种依赖TonB的外膜转运体以不需要能量的形式高效结合底物,通过与TonB的相互作用,驱动底物穿过外膜.不同种革兰氏阴性菌含有不同种类的TBDT,即使同一菌株也会同时具有几种类型的TBDT.