【摘 要】
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为探讨双孢蘑菇不同类型菌株间基因组存在的差异及开发SNP、SV等分子标记,对8个不同类型的核心种质开展基因组重测序工作.共获得9,840,696,438数据量,48,716,319对reads,Q30
【机 构】
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福建省农业科学院食用菌研究所,福建福州350014特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心,福建福州350014
【出 处】
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福建省科协第十四届学术年会分会暨2014年福建省食用菌学会学术年会
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为探讨双孢蘑菇不同类型菌株间基因组存在的差异及开发SNP、SV等分子标记,对8个不同类型的核心种质开展基因组重测序工作.共获得9,840,696,438数据量,48,716,319对reads,Q30达到80％以上.样品的reads与参考基因组H97的比对效率均在70％以上,对参考基因组H97的覆盖率均达到95％以上,平均深度分别在32X左右.基于测序数据与参考基因组的比对结果,共检测获得约3,190,387个SNP,239,874个Indel,8,070个SV.对双孢蘑菇及其两个退化突变体的SNP和Indel变异位点进行了注释.
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