不同发育时期的慈竹笋转录组分析

来源 :第十届中国竹业学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xjtcfx
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  慈竹(Bambusa emeiensis)是我国的优势竹种之一,主要分布在我国西南地区,其茎秆壁薄、竹节长、纤维长度高,是优良的纸浆原料。本研究以四个不同发育时期的慈竹笋为材料,分别提取总RNA 后进行转录组测序,对得到的原始数据进行统计和质量评估,过滤去杂质和冗余处理后,对组装得到Unigenes 数据库进行基因的结构(ORF 预测和SSR 分析)分析,功能(分别与Nr、GO、COG、KEGG、SwissProt 数据库对比,对基因的功能注释)分析和基因表达等分析,深入挖掘了差异表达的纤维素和木质素合成途径中的功能基因,以及转录因子,为从分子水平上了解慈竹笋发育过程中木质素、纤维素合成等基因调控的研究奠定了一定基础。
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