粤东杨梅品种资源遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析

来源 :广东省植物学会2012年年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:w56382955
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  杨梅(Myrica rubra Sieb.& Zucc)属杨梅科杨梅属植物,主要分布于我国长江以南地区,是一种具有很高的药用和食用价值的植物,具有潜在的市场价值.粤东地区是著名的杨梅产地,栽种杨梅的历史悠久,当地保留着大量优良的杨梅品种资源.近些年来,已有多种分子标记被用于各地杨梅品种资源的分析,但目前对粤东地区杨梅种质资源的研究主要是种质资源调查和农艺性状的研究.由于表型性状易受环境因素的影响,仅仅利用表型性状难以对粤东地区杨梅品种资源遗传多样性,品种间的亲缘关系进行科学有效地分析.本论文利用ISSR 分子标记技术对粤东地区所收集的32份杨梅品种(系)的遗传多样性进行了分析,并探究不同品种间的亲缘关系.为该地区杨梅品种资源的保护,保存管理以及育种提供参考依据.实验所用的32份材料是由广东省汕头市林业科学研究所提供.采用改良CTAB 法提取基因组DNA,经过纯化和检测完整性,于-20℃冰箱中保存备用.实验所用的ISSR 引物是由上海生物工程公司合成.在TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice(TP600)型PCR 仪上利用已优化的杨梅ISSR-PCR 反应体系进行PCR 扩增PCR 产物用1.5%的琼脂糖凝胶电泳分离,EB染色检测,BIO-PRINT凝胶成像系统拍照.统计清晰、重复出现的ISSR条带记为1,无带、弱带或不重复出现记为0.结果利用4条多态性引物共扩增出46条可重复条带,其中多态性条带有39条,多态位点百分率(PPB)为84.49%,分析揭示供试品种(系)的观察等位基因数、有效等位基因数、Neis遗传多样性指数和Shannons信息指数分别为1.8478、1.4033、0.2357、0.3596;利用NTSYS-pc2.1e软件根据Nei&Li 计算出各品种(系)之间的遗传相似系数(GS)范围在0.5909-0.9819间,平均遗传相似性系数为0.7972.表明此次试验的供试材料的遗传多样性水平可能比此前的研究所涉及的种质资源高.根据UPGMA法构建聚类树状图,在遗传相似系数为0.75水平上,可将32份杨梅品种划分为4大组.每个组分别包含有2、23、6、1个品种.研究结果虽在分子水平上揭示了32份杨梅品种间的亲缘关系,为今后开展杨梅品种资源的鉴定与保护、辅助育种、保存管理、系统进化等研究提供参考依据.但聚类结果与传统的形态学分类不十分吻合,并且品种之间的聚类与来源地没有明显联系.
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