【摘 要】
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光照是广叶绣球菌(Sparassis latifolia)原基形成及子实体发育所必须的环境因子.光受体在其中起着重要的作用.目的:通过对DASH型隐花色素基因Slcry1的序列与表达分析,为探索广叶绣球菌子实体发育及光应答机制奠定基础.方法:用关键词DNA photolyase(pfam00875)和FAD binding domain of DNA photolyase(pfam03441)搜索
【机 构】
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福建省农业科学院食用菌研究所,福州350014 特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心,福州
【出 处】
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福建省科协第十七届学术年会分会暨2017年福建省食用菌学会学术年会
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光照是广叶绣球菌(Sparassis latifolia)原基形成及子实体发育所必须的环境因子.光受体在其中起着重要的作用.
目的:通过对DASH型隐花色素基因Slcry1的序列与表达分析,为探索广叶绣球菌子实体发育及光应答机制奠定基础.
方法:用关键词DNA photolyase(pfam00875)和FAD binding domain of DNA photolyase(pfam03441)搜索广叶绣球菌基因组,找到一个候选基因,PCR扩增得到全长cDNA和基因组序列,利用PROTPARAM预测其分子质量及等电点,利用SMART和Pfam预测其保守结构域,在SWISS-MODLE中模拟其三维结构.最后,利用MEGA6软件中的邻位相连法构建系统发育村.荧光定量PCR检测该基因在广叶绣球菌不同发育阶段及光照处理下的表达量.
结果:本实验克隆了广叶绣球菌隐花色素基因Slcryl的cDNA全长.S1CRY1蛋白(584个氨基酸)包含一个DNA光解酶(DNA Photolyase)结构域和一个FAD结合(FAD binding)结构域.系统发育分析表明,S1CRY1属于光解酶/隐花色素蛋白家族中的DASH(Drosophila,Arabidopsis,Synechocystis,and Homo species)型隐花色素.实时荧光定量PCR结果显示:基因Slcry1在光照诱导下表达量上升;不同组织中,Slcry1基因的表达量水平为子实体>原基>菌丝体.
结论:S1CRY1属于DASH型隐花色素,其表达量在受光照的诱导,且随广叶绣球菌的生长发育而上升.研究结果对进一步研究该蛋白的功能具有一定的参考价值.
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