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阴阳五运的运动变化规律是天地万物变化运动的根本规律，五运六气是有周期性规律的，天气的风寒暑湿燥火也是有规律可循的，疾病的发生与五运六气及气候变化有密切关系。疫病的发生、流行与异常的气候的变化有关。《素问·五运行大论》所谓“非其位则邪，当其位则正。”疫病非独立于风寒暑湿燥火之外的特殊疾病。运用内经运气理论分析预测疫病，对当今手足口病等疫病的防控具有重大价值。