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在自然界水体中生活及实验室培养的铁细菌细胞，可以沉淀各种铁矿物，其中以铁的氢氧化物和氧化物最常见。细菌的荷电表可以吸附金属，并且它们新陈代谢产生的排泄物进入周围环境还可诱发生物矿化作用。细菌在水系中普遍存在并具有固有的生物成矿能力，因此，它们在控制现代和古代沉积环境中铁的环境起到极为重要的作用。