为了调查中国马种的群体遗传分化与遗传结构状况,本文应用FAO推荐的25对微卫星引物,结合荧光标记PCR分析技术,对中国23个马群体和英纯血马群体进行分子遗传学研究。结果表明：中国地方马群体的遗传多样性比较丰富,23个中国马群体的等位基因数、多态信息含量和遗传杂合度等都高于英国纯血马。根据群体遗传距离构建的系统进化树,能够将中国马群体分成不同的支,基本上与其地理分布格局相符。我们用MVSP软件进行群体遗传分化分析。第一、二主成分的二维散点图显示将中国的马群体分化成南方支系、藏马支系、新疆和青海支系、内蒙古支系及东北支系等5个部分。根据Structure软件分析,推测中国马群体含有的5个潜在的支系,基本上代表了我国现在主要家马来源的基础遗传支系。这些信息可以为我国现有马种类型的划分与马种资源遗传多样性的保护提供科学依据。