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大豆是动物和人类蛋白质和油脂的主要来源,研究表明现代栽培大豆大约在5000年前由其近亲野生大豆驯化,继而进一步选育而成.鉴定大豆基因组中受驯化和改良的基因对指导大豆育种具有重要意义.本课题组对302个野生种、农家种和栽培大豆品种进行了深度测序(11×),共鉴定出9,790,744个SNP,876,799个In/Del,1,614个CNV.通过全基因组水平对野生群体与农家种群体的驯化位点扫描和农家群体与栽培群体的改良位点扫描,共得到230个受选择区域,其中一些区域与驯化和改良相关性状如油份含量、百粒重等的GWAS位点相重叠.我们还发现一些驯化基因的频率存在区域分布的特异性,表明大豆育种过程中存在适应性选择过程.这些结果为大豆遗传学研究和分子模块育种奠定了重要基础.