【摘 要】
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实验通过对患有温和气单胞菌致死的鱼分离得到强毒A1株,弱毒A2株,体外培养后再进行动物回归实验,分离、提纯得到A1、A2株。并对A1、A2株进行全基因组测序,其碱基测序质量值基本为30以上,说明质量良好,并且检测AT、CG碱基比例分布平缓、未发生分离,测序结果正常,与参考基因对比率约为75.86%,插入片段符合正态分布,基因组覆盖深度、覆盖度均正常,为此基因测序结果准确;比较温和气单胞菌强毒和弱毒
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实验通过对患有温和气单胞菌致死的鱼分离得到强毒A1株,弱毒A2株,体外培养后再进行动物回归实验,分离、提纯得到A1、A2株。并对A1、A2株进行全基因组测序,其碱基测序质量值基本为30以上,说明质量良好,并且检测AT、CG碱基比例分布平缓、未发生分离,测序结果正常,与参考基因对比率约为75.86%,插入片段符合正态分布,基因组覆盖深度、覆盖度均正常,为此基因测序结果准确;比较温和气单胞菌强毒和弱毒株基因水平上的差异,得出A1、A2株SNP突变基因量大,A1、A2株之间SNP突变量约为615bp,这些突变SNP位点可能影响菌株的毒力差异,A1株发生非同义突变基因数量2492、发生小的插入缺失（SmallInDel）的基因数640、发生SV变异基因数94;A2株发生非同义突变基因数量2492、发生小的插入缺失（SmallInDel）的基因数636、发生SV变异基因数78;并对检测结果进行图表对比分析。同时A1株发生插入类型变异数量29;缺失类型变异数量77;反转类型变异数量4;无染色体内易位类型变异;染色体间易位类型变异数量61。A2株株发生插入类型变异数量38;缺失类型变异数量105;反转类型变异数量4;染色体内易位类型变异数量6;染色体间易位类型变异数量70。同时用时聚合酶链反应对数据进行了验证,验证结果基本一致。
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