一例相互易位染色体断裂重接点定位方法探索

来源 :第十二次全国医学遗传学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mxhcxp11
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  背景 染色体的相互易位(Reciprocal translocation)是两条染色体同时各发生一处断裂和变位重接而形成的两条结构上重排了的染色体.这种易位大部分仅表现为染色体结构的改变,没有遗传物质的丢失,对基因作用和个体发育一般无严重影响,称为平衡易位(Balanced translocation).据报道,存在染色体相互易位的人类新生儿中,约6%表现出先天畸形或发育迟缓等.造成疾病表型的原因主要包括单个基因或多个基因的直接断裂、顺式作用元件与其作用的相关基因的分离、微缺失或微重复以及多个基因的连接等.由于以上机制,使得基因内部结构或基因与其作用元件相对位置改变,从而引起基因表达异常而表现出疾病表型.常规细胞遗传学检测只能对断裂区域作出粗略估计,无法精确定位.新发展起来的Array painting及多种基于第二代测序技术的定位方法对实验人员的数据分析能力要求严格,且费用昂贵.对象一例体格发育尚可,智力发育障碍并伴有头部不自主摇动等异常表型的染色体相互易位患者,其染色体核型为46,XX,t(5;15)(q21.1;q21.2),15pss.其父母染色体正常,患者Illumina HumanCytoSNP-12基因芯片检测未见异常.方法 运用细胞遗传学、分子细胞遗传学、分子遗传学等相关技术,从三条技术路径尝试对染色体断裂点进行精确定位:1、短片段探针荧光原位杂交定位法;2、长片段PCR定位法;3、激光显微切割与PCR结合定位法.结果方法1和方法2未能得到理想结果,运用方法3将断裂点定位在小于2kb范围内.结论1、通过BAC-FISH技术可以将染色体断裂点范围定位在150kb~250 kb之间,而自制的短片段探针FISH可定位在10kb~范围.2、长片段PCR理论上可以将染色体断裂点定位到单个碱基,但往往由于非特异性扩增难以得到理想的实验结果.3、激光显微切割与PCR结合法用于对染色体断裂点的定位时,可简单、稳定、经济的定位到1bp~2kb,是理想的单样本染色体断裂点定位技术.
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