【摘 要】
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以蝴蝶兰品种‘满天红’及其花色突变体的花苞和花瓣为研究材料,利用Illumina HiSeqTM2000测序平台进行高通量测序,并进行SSR位点搜索,结果搜索到SSR的序列共6289条,得到7077
【机 构】
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广东省农业科学院环境园艺研究所; 广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室;
【基金项目】
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广东省科技基础条件建设项目(2013B060400032);国家自然科学基金(31201650);广东省专业镇中小微企业公共服务平台建设(2012B091400032);东莞市科技计划项目(2012108101021)
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以蝴蝶兰品种‘满天红’及其花色突变体的花苞和花瓣为研究材料,利用Illumina HiSeqTM2000测序平台进行高通量测序,并进行SSR位点搜索,结果搜索到SSR的序列共6289条,得到7077个SSR,其中有694条序列不止含一个SSR。微卫星序列主要以二碱基重复单元为主,占总数的50.4%,其次为三碱基重复单元,占39.3%。在所有重复类型中,最主要的优势重复单元为AG/CT,占所有类型的31.8%,其次为AT/AT,占所有类型的12.9%。分析发现,蝴蝶兰微卫星长度变化与重复单元长度呈负相关（p<0.05）,相关系数为-0.759。本研究通过高通量测序获得了大量的蝴蝶兰转录组信息,为今后蝴蝶兰的分子标记和基因组研究的发展提供一定的理论基础。
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