一株类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒的全基因序列分析

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为监测猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)流行毒株的基因变异情况,采用RT-PCR方法对某猪场疑似患有猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratorysyndrome,PRRS)的病料进行鉴定,证实为PRRSV感染。将该株PRRSV命名为180404-2fei,并测序获得全基因。对180404-2fei的NSP2基因缺失特征分析表明:在NSP2区存在111+1+19aa个氨基酸的不连续缺失,与报道的类NADC30毒株缺失特征一致;同源性分析结果表明:180404-2fei的NSP2基因与NADC30毒株核苷酸和氨基酸同源性分别为92.2%和90.1%;ORF5基因与NADC30的核苷酸及氨基酸序列同源性分别为93.5%和92.0%。对NSP2基因、ORF5基因和全基因进化树分析结果表明:180404-2fei毒株属于NADC30-Like亚群。重组结果表明:180404-2fei是由NADC30与HP-PRRSV重组而成。本研究对一株类NADC30 PRRSV进行基因组分析,为研究PRRSV的遗传变异和PRRS的防控提供参考依据。
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