目的利用全基因组DNA甲基化芯片,检测蜈蚣提取物（Centipede Scolopendra extraction,CSE）处理后人肝癌细胞全基因组水平DNA甲基化谱情况,并对全基因表达谱芯片的差异基因进行注释系统（gene onto1ogy,G0）分析。方法 MTS法检测CSE对人肝癌细胞HCCLM3增殖的影响,并计算细胞增殖半数抑制率(IC₅₀)。以1/2 IC₅₀浓度的CSE连续处理72 h,设置空白对照组。收集细胞提取基因组DNA,采用全基因组甲基化芯片进行基因组DNA甲基化检测,分析筛选甲基化差异性位点。结果（1）MTS检测结果显示,CSE以剂量依赖方式抑制人肝癌细胞的生长,IC₅₀值为0.613 mg/mL。（2）全基因组甲基化芯片检测结果显示:①经CSE处理72h时,CSE处理组与空白组甲基化谱发生了明显变化;初筛差异明显有意义的甲基化位点有:EPHB4、UTRN、DHX15、H19基因;②经5-Azacytudine处理72 h时,5-Azacytudine组与CSE处理组比较甲基化谱差异,经过初筛,变化较为明显的位点有,FHL1、EIF4G1、DLX2、H19、EBF3基因。（3）对全基因表达谱芯片的差异基因进行注释系统（gene ontology,GO）分析,蜈蚣组与空白组比较总共有3847个基因表达水平发生了变化,其中上调1837个基因,下调2010个基因,G0分析结果发现这些改变发生在细胞线粒体、细胞膜以及胞浆中,参与代谢和转运等生物学过程。在Pathway分析结果中显示共有3个信号通路发生了显著性变化,具有显著性意义。