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本文介绍了GEANT4程序并行的一般方法，对GEANT4.9.1进行了编译环境的改造，优化了编译参数，顺利地在高性能计算机Linux-icc系统下进行安装。并用其计算了电子入射多层介质时的能量沉积曲线，给出了不同并行度计算时的加速比，与MCNP计算相同问题的结果进行了比对。结果表明，高性能计算机下的GENAT4软件并行计算时加速比随并行度呈线性增长，计算结果也与MCNP的计算结果相符。