华东地区鸡源H9N2亚型AIV分离株HA基因的进化分析

来源 :第十五次全国家禽学术讨论会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dannychan
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本研究从2010年2月至2011年2月在华东地区免疫鸡群中分离到10株鸡源H9N2亚型禽流感病毒(AIV),并对分离株进行血凝素(HA)基因序列测定和进化分析,力图从分子水平上探讨华东地区H9N2亚型AIV的流行情况和变异规律.研究结果表明,所有分离毒株HA基因开放阅读框(ORF)全长为1683bp,编码560个氨基酸.分离株之间HA基因核苷酸序列同源性在89.0%~99.6%之间,与3株国内疫苗毒株(SS94,SD696,F98)HA基因核苷酸同源性在92.5%~94.5%之间.分离株除福建株A/Chicken/Fujian/SL6/2011外,都比国内使用的3株疫苗毒株在第295位新增一个潜在糖基化位点.本研究10个毒株HA蛋白裂解位点附近序列有2种形式:PSRSSR↓GLF和PARSSR↓GLF,无连续碱性氨基酸的插入,符合低致病性禽流感的特征.遗传进化分析显示,分离株和国内使用的疫苗株均属于欧亚种系类Y280亚分支,亚分支内部10个分离株和疫苗株亲缘关系较远,在一定程度上反映了华东地区H9N2亚型流行毒株与国内主要疫苗毒株有一定的进化距离.
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