【摘 要】
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硝酸盐同化作用是原核生物中主要的脱氮途径之一,由细菌同化硝酸盐基因簇中nasA编码的同化硝酸盐还原酶催化.在本文中,根据Halomonas Alkaliphila菌株X3的全基因组预测到nasA.通过PCR和酶活性检测验证该基因真实存在,然后运用DNAMAN软件将测得序列拼接后获得nasA全序列为2071bp,对应氨基酸序列的13-587aa属于Molybdopterin-binding超家族；5
【机 构】
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黄海水产研究所,中国水产科学研究院,青岛,266071
【出 处】
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第二十次全国环境微生物学学术研讨会
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硝酸盐同化作用是原核生物中主要的脱氮途径之一,由细菌同化硝酸盐基因簇中nasA编码的同化硝酸盐还原酶催化.在本文中,根据Halomonas Alkaliphila菌株X3的全基因组预测到nasA.通过PCR和酶活性检测验证该基因真实存在,然后运用DNAMAN软件将测得序列拼接后获得nasA全序列为2071bp,对应氨基酸序列的13-587aa属于Molybdopterin-binding超家族；594-712aa属于MopB_CT超家族；847-896aa属于NirB超家族.在该酶预测的二级结构中α螺旋占34.54％,β转角为9.65％,延伸链为17.65％.在nasA编码的蛋白质中没有预测到信号肽,表明同化型硝酸盐还原酶是胞内酶.系统发育分析表明菌株X3中的nasA与同属细菌的该基因同源关系较近,例如Halomonascampaniensis.
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