目的探讨VENTANA全自动免疫组化法(VENTANA IHC)和手工免疫组化法(手工IHC)检测肺腺癌中间变性淋巴瘤激酶(ALK)突变的差异性。方法采用VENTANA IHC和手工IHC分别检测120例肺腺癌患者肿瘤组织中ALK基因突变,并用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法进行验证。结果在120例病例中,采用VENTANA IHC、手工IHC和RT-PCR检测,EML4-ALK阳性的例数分别为14例(11.7%)、19例(15.8%)和15例(11.6%)。与RT-PR相比较,VENTANA IHC检测的敏感性和特异性分别为93.3%和100%,二者之间的总符合率为99.1%;手工IHC的敏感性和特异性分别为82.4%和95.1%,二者之间的总符合率为93.3%。结论VENTANA IHC和手工IHC检测EML4-ALK的结果与RT-PCR具有一致性(P<0.05),都可以作为肺腺癌患者EMIA-ALK的检测,但VENTANA IHC的准确性高于手工IHC。