【摘 要】
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采用典型群内随机抽样方法,采集鲁西牛(LX)、渤海牛(BH)和天祝牦牛(YK)颈静脉血样,用酚/氯仿法提取其DNA,通过PCR-Sequencing技术获得各群体的Myf5基因exon1和5端侧翼序列,与GenBank已公布的牛亚科动物的相应序列(ACCESSION:M95684)作同源比对分析,构建Neighbour-Joining种系进化树.结果显示,LX和YK牛各存在1个多态位点,分别定义了
【机 构】
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烟台大学生命科学学院 烟台大学计算机学院,山东,烟台,264005
【出 处】
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2011中国肉牛选育改良与产业发展国际研讨会
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采用典型群内随机抽样方法,采集鲁西牛(LX)、渤海牛(BH)和天祝牦牛(YK)颈静脉血样,用酚/氯仿法提取其DNA,通过PCR-Sequencing技术获得各群体的Myf5基因exon1和5端侧翼序列,与GenBank已公布的牛亚科动物的相应序列(ACCESSION:M95684)作同源比对分析,构建Neighbour-Joining种系进化树.结果显示,LX和YK牛各存在1个多态位点,分别定义了2种单倍型;BH牛未发现多态位点.核苷酸多样性(Pi)在0.00000～0.00078之间,说明群体内遗传多态性程度较低.核苷酸替代存在转换和颠换两种类型,二者之比为2∶1.LX牛的1处碱基替换发生在密码子的第三位,为同义突变.YK的3处替换均发生在密码子的第二位,其中g.271 C→G导致编码氨基酸T→R,g.433 C→T导致P→L,而g.610T→A使得编码L的密码子TTA形成终止子TAA.核苷酸歧义度(Dxy)分析表明,所研究的牦牛与LX牛及与BH牛间的核苷酸歧义度(Dxy)远高于后两者的Dxy,说明存在一定程度的分化.种系进化树分析表明,牦牛与普通牛聚为一支的自展值达93,表明二者亲缘关系较近,而与水牛和大额牛遗传距离较远,支持将牦牛归为牛属(Bos)的一个亚属或一个种的观点.
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