利用大粒材料定位水稻粒形性状数量基因位点

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水稻的粒长、粒宽、粒厚、粒重等粒形性状直接影响产量,研究粒形性状的遗传对指导水稻的高产育种有着重要的理论和实践意义。近20年来,利用AFLP、SSR等分子标记定位了许多控制粒重和粒形的QTL或基因,几乎分布于水稻的全部12条染色体。目前已经克隆了GS5、GS3、GW2、qSW5、GW5、srs-3和Ghd7,精细定位了gw3.1、qGL7、qGL7-、gw8.1、TGW3b和gw9.1,其他多数QTL有待进一步验证和精细定位。分析这些定位群体中双亲千粒重大都小于50g,受双亲粒重差异范围限制,这些QTL往往解释粒重和粒形的效应值通常较小。选用特大粒资源与粒重差异较大的亲本间进行粒形的遗传研究有可能获得较理想的结果。本研究利用一个千粒重达72g左右的特大粒资源(TD70)与籼稻Kasalath(千粒重约为13g)构建的240个株系组成的重组自交系群体,采用QTLIciMapping软件,以完备区间作图法,以LOD≥2.5作为选择阈值,对2010年和2011年的粒长、粒宽、粒厚和粒重进行QTL扫描。由于年底间籽粒灌浆差异,两年共检测到5个控制粒长的QTL,6个控制粒长的QTL,6个控制粒宽的QTL,7个控制粒厚的QTL,和6个控制千粒重的QTL;其中在2年中均被检测到的粒长QTL分别为qGL3-1,粒宽QTL为qGW2-1、qGW2-2、qGW5-1、qGW5-2;粒厚QTL为qGT2-3、qGT3-1;粒重QTL为qTGW2-1和qTGW3-1,其平均贡献率分别为56.19%、4.42%、29.41%、10.37%、7.61%、21.19%、17.06%、11.51%和40.65%。其中第2染色体RM1347-RM5699区间是与粒长、粒宽、粒厚和粒重均相关的共同标记区间,与克隆的粒宽基因GW2位置,可能为同一区域。第3染色体RM6080-RM6832区间是分别为qTGW3-1、qGL3-1、qGT3-1与gw3.1和GS3位置相近,定位的第5号染色体RM413-RM3777标记区间的qGW5-1和qRLW5-2还未见定位报道,有可能为新的粒重或粒型QTL。由于不同粒重的亲本含有控制粒重的不同QTL或基因,定位群体不一样,QTL的数目也不一样,研究中并没有定位到其他已报道的精细定位和克隆的基因,有待于进一步研究。
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