玉米起源于热带和亚热带地区,对低温环境反应敏感。提高玉米的低温发芽能力可以增强品种的适应能力,实现早播、苗齐和苗壮,延长玉米的生育期,为高产打下基础。本研究采用两个低温发芽能力高的玉米自交系220和P9-10,以及两个低温出苗能力弱的两个自交系Y1518和PH4CV,配制了三个相关的F2:3群体(220×PH4CV,220×Y1518和P9-10×PH4CV)。试验采用5个指标(出苗率/ER,发芽指数/GI,幼苗总长肌,幼苗根长/RL和幼苗芽长/SL)鉴定亲本和分离群体的10℃低温发芽能力,分别采用沙床鉴定(前两个指标)和卷纸鉴定(后三个指标)。并用6K玉米SNP芯片做基因型鉴定。表型鉴定结果表明,群体内不同系表型变异明显,且5个指标显著正相关。利用三个群体共定位到67个QTL。QTL的表型变异贡献率(PV)处于0.33%-39.44%之间。其中有17个QTL的PV超过了10%,且除一个QTL外,其余QTL的有利等位均来自于低温发芽能力高的两个自交系。将三个遗传图谱整合得到一致性图谱,并将67个QTL定位到一致性图谱上,如果来自于不同群体的QTL(1)位置或一端标记相同,(2)置信区间部分重叠,或(3)遗传距离小于5cM,我们将这些QTL视为一个cQTL。最终鉴定到6个cQTL。其中cQTL2-2包含的QTL来源于全部三个群体,其余5个cQTL包含的QTL来自于其中两个群体。与前人的结果对比发现,该6个cQTL均曾被检测到过。这些结果表明,本研究发现的cQTL对揭示玉米种子低温发芽能力的遗传机制具有重要意义,并为进一步的基因克隆和分子标记辅助育种提供重要的基础。