稀有鮈鲫的角蛋白18基因与启动子序列的克隆及序列分析

来源 :2010年中国水产学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:puhongjin
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  角蛋白属于中间纤维蛋白按表达类型分可分为E型角蛋白和S型角蛋白.含有S型角蛋白的上皮组织有上皮细胞、前肾管、消化管、脊动脉管、皮肤等.角蛋白18属于S型角蛋白.通过对稀有鮈鲫的角蛋白18基因的克隆及序列分析,旨在从分子水平上了解角蛋白18的特性.根据已发表的斑马鱼的角蛋白18氨基酸序列与人、爪蟾的氨基酸序列进行同源性比较得到的保守序列在斑马鱼中找到相关DNA序列从中设计二对引物,得到2779bp的稀有鮈鲫角蛋白18的DNA序列片段,再通过基因组步移得到上游和下游序列得到基因全长序列3745bp,与大肠杆菌(Escherichia coli)克隆载体pMD19-T连接获得含有全长基因的重组质粒并测序.对该基因进行NCBI的blastn同源性比较分析结果表明:其基因32%序列与人的角蛋白18基因同源性达89% ,与斑马鱼角蛋白18基因的核苷酸同源性最高,同源性达到99%.氨基酸序列与斑马鱼的角蛋白18的同源性达到77.88%.并对该基因的ORF进行生物学分析.同时,继续向上游步移获得启动子,得到的序列进行启动子的序列分析.
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