针对高危复杂性肛瘘危害较大，在治疗中存在要彻底清除病灶使引流通畅而达根治，势必损伤括约肌而影响肛门的括约功能，若要保护好肛门功能，又存在病灶清理不彻底，引流不通畅的问题，根据个人的认识和临床体会，结合相关文献分三部讨论：首先分析了肛瘘不愈与复发的常见原因，接着探讨了肛瘘根治的关键和处理办法。笔者认为有三：(1)准确寻找和正确彻底的处理内口；(2)保持引流通畅防止假愈合；(3)防止感染，杜绝异物残留，做好相关治疗。最后阐述了保护肛门功能的方法和措施：(1)寻求最佳术式，因病而异选用适当的方法是保护肛门功能的最好办法；(2)术中应最低限度的减少肛门组织损伤，最大限度的保护好肛门功能为原则。此外，尚要养成良好的生活和饮食习惯，增强体质，提高免疫力和调节好激素代谢，才能确保最佳效果。