人类B细胞淋巴瘤-2癌基因(Bcl-2)在乳腺癌、结直肠癌等多种肿瘤细胞中存在异常的过度表达,与肿瘤细胞凋亡抑制密切相关[1]。有研究发现,位于癌基因Bcl-2启动子区的一段富含鸟嘌呤(G)的DNA序列,通过阳离子(K+或Na+)的诱导可自发折叠形成分子内G-四链体[2]。而小分子的特异性识别可以稳定该G-四链体,进而调节Bcl-2的转录和表达过程。因此,癌基因Bcl-2启动子G-四链体DNA已成为治疗肿瘤疾病的潜在靶点。本文建立了高分辨质谱(HRMS)结合毛细管前沿分析(CE-FA)系统研究G-四链体DNA与天然活性分子相互作用的组合分析方法。首先,利用HRMS快速初筛出与靶标DNA结合的天然产物分子。考虑到液相状态下,往往特异性与非特异性结合并存。这里提出一个CE-FA的新公式,在无需扣除非特异性结合的情况下,直接获得天然产物分子特异性结合的结合常数和结合比[3]。该组合方法不仅分析速度快,而且能够提高亲和分析的准确度和特异性,并有望用于其他靶向药物先导结构的筛选。