一种稳定的基于G-三链体DNA和小分子染料的非标记荧光探针

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继G-四链体DNA被发现和广泛报道之后,G-三链体是近年来被发现的一种DNA二级结构。它可由含三段连续G碱基的富G核酸序列,在一定条件下自组装形成1。近年来有研究表明G-三链体DNA可能具有G-四链体类似的特性3。然而,目前有关G-三链体DNA的研究非常少,这可能与其结构不稳定有关1,4。报道最多的5‘-GGTTGGTGTGG-3‘G-三链体序列,其解链温度约33.5℃。本实验小组发现了一段G-三链体DNA序列,折叠成G-三链体结构后其解链温度可达60℃(图1)。该G-三链体序列可与小分子染料结合,不仅可使G-三链体的解链温度提高至83℃,而且可使小分子染料增强数倍(图1)。鉴于此,我们将该荧光探针运用于非标记分子信标的构建。实验结果表明与传统基于G-四链体DNA的分子信标相比,基于G-三链体DNA的分子信标对茎部碱基的序列要求更低,从而使得设计更加灵活。
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