霜霉病菌诱导下大白菜SSH文库的构建和分析

来源 :中国园艺学会十字花科分会第七届学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cheney0105
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以抗霜霉病DH系T12-19为材料,构建了霜霉病诱导表达的正向差减杂交文库,并利用反向Northern斑点杂交技术对768个阳性克隆进行了筛选,共获得57个病原菌诱导上调表达的克隆。测序后得到55条通读EST,对这些EST序列进行聚类和拼接分析,共获得50个unigenes。在NCBI上进行BLASTx和BLASTn同源比对,同时在国际白菜基因组网站上进行BLASTn/unigene比对。结果表明,36个unigenes与已知基因高度同源,占全部非重复序列的65.5%。对已知功能基因进行功能分类,发现这些基因的功能主要涉及信号转导、转录调控、物质与能量代谢、蛋白质合成与代谢、膜及转运、抗病防御等。
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