东海滩涂养殖贝类大肠杆菌宿主来源的微生物源示踪(MST)研究

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本实验旨在运用微生物源示踪(MST)的方法研究东海滩涂养殖贝类水环境中大肠杆菌(E.coli)污染的可能来源。东海象山港采样分离获得不同宿主来源(人、牛、羊、猪、鹅、鸡、鸭)的E.coli菌株492株,采用REP-PCR和BOX-PCR基因指纹分析技术对不同菌株进行基因分型,并用InfoQuestFPTM软件(bio-rad)分析基因指纹图谱。结果表明,BOX-PCR方法比REP-PCR获得的基因多态性更丰富,且具有更高的正确聚类率(RCC),不同来源宿主其RCC值分别为:人96.55%,牛81.63%,猪96.77%,鸡88.54%,鸭97.37%,羊90%,鹅89.65%。REP-PCR和BOX-PCR的平均正确聚类率(ARCC)分别为80.69%和91.51%。此外,我们还分析了分离自贝类样品的459株E.coli,发现:中游养殖水域的贝类样品分离株中92.4%与畜禽分离株相似率达80%以上,下游养殖水域的贝类样品分离株中96.2%与人源、畜禽分离株相似率达80%以上。表明人源和畜禽源E.coli可能会扩散污染贝类养殖水环境,从而影响贝类产品的源头安全。
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