虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)肿瘤坏死因子受体(TNFR)的全基因组鉴定、进化分析和其在免疫应答中的表达谱构建

来源 :2015中国遗传学会大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tx9yky2w
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  虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)隶属于软体动物门、瓣腮纲、珍珠贝目,扇贝科,为大型冷水性双壳贝类,主要分布于俄罗斯远东海、千岛群岛、日本北海道、本洲北部,以及朝鲜北部海域.自1982年引进中国后,虾夷扇贝一直是我国北方最重要的海水养殖种类之一.近年来,养殖虾夷扇贝出现大批死亡现象,给养殖者带来了巨大的经济损失.作为无脊椎软体动物的虾夷扇贝缺乏获得性免疫,因此在应对外界细菌、病毒等刺激时其先天免疫系统发挥着至关重要的作用.TLR信号传导通路是无脊椎动物最具代表性的先天性免疫通路之一,作为该通路关键成员的肿瘤坏死因子受体(TNFR)基因对整个TLR系统的细胞凋亡、器官形成等起着至关重要的作用.本研究通过筛查虾夷扇贝的基因组和转录组,对该基因进行了筛查和鉴定,并对其在各个物种中的系统发生关系进行了分析.分析显示,虾夷扇贝基因组中共含有2个TNFR基因:PyTNFR1,PyTNFR2.通过对CRD(半胱甘酸富集功能域)和TNFR功能域的分析,研究发现虾夷扇贝TNFR基因可被分为功能域保守(PyTNFR1)和功能域不保守(PyTNFR2)两种类型.在构建的系统发生树中可以发现,功能域保守型的PyTNFR1与原口动物的在进化上更为接近,功能域不保守型的PyTNFR2则与后口更为接近,并且推断PyTNFR2可能由PyTNFR1分化而来.
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