福建省PEDV流行病学调查与S基因变异分析

来源 :福建省科协第十五届学术年会畜牧兽医分会场——福建省畜牧兽医学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaowangjianfeng
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为了解PED在福建省的流行和流行毒株S基因的变异情况,本研究对2011-2014年采自117个规模猪场的295份疑似PED的病料进行检测,对14株具有代表性的PEDV毒株进行S基因序列分析.结果2011-2014年病料阳性率分别为87.30%,75.00%,40.91%和34.15%,总的阳性率为69.49%,可见PED在福建省仍然比较流行.基因序列分析表明14株PEDV分离株S基因核苷酸之间的同源性分别为98.5%~100.0%,与国内其他毒株之间的同源性为93.3%~99.5%,其中与国内2009年以前其他PEDV毒株的同源性较低;与2008年泰国NPPED2008_2株的同源性分别为95.8%~96.1%;与CV777标准株的同源性为93.8%~94.1%.分离毒株的S基因片段氨基酸存在多个位点突变、插入和缺失现象.遗传进化树表明14株PEDV分离株与2008年泰国NPPED2008_2毒株和2009年韩国毒株亲缘关系较近,与attenuated DR13弱毒株及CV777标准株亲缘关系比较远.14株PEDV的S基因序列已登陆Genbank.
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