磁轴承作为一种无接触的支承结构，具有无摩擦、无需润滑和支承刚度主动可控等特点，在高速电机、分子泵和航天器姿态控制等领域有着广泛的应用。但是磁悬浮转子受限于加工精度，不可避免地存在残余不平衡质量，在高速旋转情况下产生的不平衡力，通过基座传递给外部机构，导致振动和噪声。利用磁轴承主动可控的特点，可以对不平衡质量产生的振动力予以消除，实现零同频振动控制。磁悬浮转子的不平衡质量产生不平衡力，向外传递振动。为了全转速范围内消除不平衡振动力，提出一种基于相移陷波器的不平衡振动全频自适应控制方法。该方法直接以构造出的轴承力作为相移带通滤波器的输入，将滤波器的输出反馈至控制系统，构成相移陷波器，达到消除振动力的目的，该过程不需要考虑功放的低通特性对同频成分的影响；通过对系统灵敏度函数理论分析，在不同转速下自适应调节相移角，实现了在全转速范围内系统的稳定。实验结果表明该方法能够在全频范围内有效地消除同频轴承力，验证了该方法的有效性。