本文使用三阶段数据包络分析(DEA)模型对30个国家和地区在1993-1997年以及1998-2002年两个时期内的科学投入产出绩效进行评价。第一阶段运用DEA方法对30个国家和地区的科学绩效进行了评价,结果表明各个国家之间的科学绩效存在较大的差异。受环境及随机因素的影响,与欧美科学强国相比,我国的科学研究投入产出效率尚处于很低的水平;第二阶段使用随机前沿分析(SFA)方法修正第一阶段的投入指标,选择GDP,计算机使用量(CIU)、大学教育情况(UE)、生活质量(QOL)和对科技的兴趣(IST)作为环境变量对第一阶段的投入冗余进行回归;基于调整后的投入指标,第三阶段对30个国家和地区重复使用DEA方法进行评价,结果表明消除了环境变量及随机误差的影响之后,总体上,国家的科学绩效有较大提高,并且国家之间的科学绩效差异也明显减小。与欧美科学强国相比,研究结果揭示了环境变量及随机误差对我国的科学研究绩效具有显著的负面影响。第一阶段的DEA绩效与第三阶段的DEA绩效无显著的相关关系,这说明不同国家所处的科研环境的差异性影响了国家的投入产出效率,同时也证明三阶段DEA方法使用的必要性。