目的:构建局灶性脑缺血模型大鼠脑基底节蛋白质组差异表达图谱,探讨针刺对局灶性脑缺血大鼠基底节蛋白质组表达的影响。方法:选用40只Wistar大鼠,随机分为4组,每组10只,分别为正常组、假手术组、模型组和针刺组。模型组和针刺组采用颈内动脉插入线栓法建立大脑中动脉阻塞模型。针刺组选醒脑开窍针法主穴内关、人中穴进行针刺。各组大鼠在规定时间快速断头取脑,提取脑基底节蛋白质,进行双向电泳(第一向固相pH等电聚焦电泳,第二向垂直平板SDS-PAGE)。考马斯亮蓝R-350染色后,扫描至Dell工作站中,ImageMaster 2D Elite v3．01软件对2-DE图谱进行蛋白质点匹配率及差异表达分析,寻找差异表达蛋白质点,以MALDI-TOF-MS技术结合数据库检索进行蛋白质鉴定。结果:经过对比分析,找到质和／或量有明显改变的15个点。其中,在模型组表达上调经醒脑开窍针刺法治疗后下调的2个点;治疗后进一步上调有3个点。在模型组下调经法治疗后上调有4个。在模型组有变化治疗后未发生明显变化有4个。在模型组无变化经治疗后出现变化的有2个。结论:以蛋白质组学技术发现了一系列与脑缺血性损伤相关的蛋白,并确定了醒脑开窍针刺法治疗脑缺血的部分靶蛋白,有助于深入研究脑缺血性损伤病理机制及针刺作用机制。