【摘 要】
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目的:采用靶向蛋白质组学方法筛选HBV相关性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)与Rab14相互作用的蛋白,并用生物信息学方法分析Rab14相互作用蛋白,探讨Rab14参与HBV
【机 构】
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中南大学湘雅医院 检验科,湖南长沙,410008
【出 处】
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第9届中国健康服务业大会暨中华医学会第七次全国健康管理学学术会议
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目的:采用靶向蛋白质组学方法筛选HBV相关性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)与Rab14相互作用的蛋白,并用生物信息学方法分析Rab14相互作用蛋白,探讨Rab14参与HBV相关性HCC生长及侵袭的可能分子机制.方法:用激光捕获显微切割(LCM)技术纯化肝癌细胞、免疫共沉淀结合质谱筛选Rab14相互作用蛋白,用DAVID v6.7对Rab14相互作用蛋白进行GO、功能聚类、信号通路分析,用String 9.1进行PPI分析.结果:筛选到133个Rab14相互作用蛋白,主要涉及9种功能:分子伴侣、囊泡介导转运、细胞骨架、GTP结合、蛋白转运、Ras相关蛋白、跨膜转运、核糖体蛋白和离子转运;涉及四条Biocarta信号通路和七条KEGG信号通路,其中3个蛋白涉及到囊泡转运通路,9个蛋白涉及内吞通路,7个蛋白涉及MAPK通路.Rab14能通过RAB5A与TFRC、AP1G1相互作用,通过DNM2与CTNNA1、TF、VCL相互作用.结论:首次采用靶向蛋白质组学方法在HCC细胞中鉴定到133个Rab14相互作用蛋白,主要涉及9个功能:分子伴侣、囊泡介导转运等;涉及四条Biocarta信号通路和七条KEGG信号通路;Rab14能通过RAB5A与TFRC、AP1G1相互作用,通过DNM2与CTNNA1、TF、VCL相互作用,调节囊泡转运、细胞粘附等,可能参与HCC的发展和转移.
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