多位点分型技术应用于浙江省脑膜炎奈瑟菌基因分型研究

来源 :第六届传染病防控技术研究与应用技术论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kikox3
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:对浙江省2004~2013年分离的54株脑膜炎奈瑟菌(Neisseriameningitidis,Nm)进行基因分型研究,了解菌株间的遗传进化关系. 方法:参照细菌分子分型和基因组差异公共数据库(Pubmlst)提供的引物与方法,获得多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)序列型(Sequence Type,ST).采用进化分析软件(Splitstree)4、聚类分析软件(eBURST)V3等处理所得序列数据,并构建遗传进化图谱. 结果:54株Nm得到21个STs,其中11个STs为新发现,主要序列型ST-7和ST-4821分别占29.63%和27.78%.不同血清群其STs/ST-克隆群(Complex)有明显不同,A群菌株78.95%(15/19)为ST-7/ST-5Complex(15/19);B群菌株STs分散,57.14%(8/14)呈单体存在;C群菌株82.35%(14/17)为ST-4821/ST-4821Complex.不同来源分离株其ST-Complex不同,来自病人及密切接触者分离株ST-5Complex分别占48.15%(13/27)及33.33%(4/12)、ST-4821Complex分别占40.74%(11/27)及25.00%(3/12),而来自健康带菌者分离株ST-4821Complex克隆群占40.00%(6/15).7个管家基因的核苷酸多态性(Pi)范围为0.01298(adk)~0.11100(aroE).Splitstree4构建径向系统进化树显示,浙江省Nm菌株分属5个分枝,主要序列型ST-7及ST-4821分别分布于3分枝及2分枝中,4分枝中均为浙江省STs.eBURST V3聚类分析发现,浙江省STs/ST-5Complex基因型相对稳定,但浙江省STs/ST-4821Complex基因型已具遗传多样性变化. 结论:浙江省Nm以A群78.95%(15/19)ST-7/ST-5Complex和C群82.35%(14/17)ST-4821/ST-4821Complex两大克隆群占绝对优势,B群57.14%(8/14)呈单体分散.浙江省A、B、C群均存在ST-4821Complex相同基因型菌株,可能不同血清群之间已产生荚膜转换,其种群间已显示基因重组进化特征,这是中国首次从A群Nm中检出ST-4821/ST-4821Complex及ST-5798/ST-4821Complex菌株.
其他文献
目的:2014年9月19日福建省建瓯市东峰镇报告登革热疫情,探讨症状监测在2014年福建省建瓯市东峰镇登革热暴发早期发现中的作用.方法:回顾性的从东峰镇卫生院收集2013、2014年8月~11月门诊日志以及2014年同期的清开灵注射液10ml(支)、利巴韦林注射液0.1g(支)等药物的使用量.使用SAS9.2软件从门诊日志中提取诊断名为发热的病例,统计每日的发热人数、发热人次数.分析发热人数、发热
本文对于濮阳地区分离到的7株手足口病例肠道病毒71型进行了全基因测序研究,经过初步分析,得出了ev71病毒在濮阳地区的分类和发育图谱.分离得到的7株毒株均属于ev71C4a亚型,其中6株呈现聚类分布,经比对与山东临沂分离株相似度最高;另一株则与浙江宁波分离株相似度最高.在同一时期、同一地区,轻重症病例分离到的毒株vp1区段没有差别,而全基因区段存在一定的差别,这些位置的变异很可能是导致轻重症病例的
目的:2014年10月浙江省金华市荣光小学发生疑似病毒性脑膜炎暴发疫情,为及时查明病因,分析病原的分子特征并进行病原溯源.方法:开展流行病学调查,采集患者脑脊液和咽拭子样本6份,检测人类肠道病毒(humanerterovirus,HEV)核酸和分离病毒,对HEV分离株VP1基因测序,进行同源性与进化分析.结果:在全校328名学生中,发病7例,罹患率2.13%(7/328).患者年龄7~8岁;临床症
目的:探索札如病毒所致幼托儿童急性胃肠炎暴发疫情的特点.方法:对2起札如病毒所致幼托儿童急性胃肠炎暴发疫情进行现场流行病学调查,对采集的样品进行细菌性和病毒性检测,对5例阳性病例的排毒期进行追踪.结果:2起暴发疫情病原为札如病毒,共23人发病,班级内罹患率分别为36.67%和30.77%,临床表现以呕吐和腹痛症状为主,分别占发病人数的100%和69.6%,病例排毒期在6-13天之间,中位数为9天.
目的:分段表达并纯化肾综合症出血热病毒核蛋白,应用array-ELISA技术评价重组表达的核蛋白片段的诊断价值.方法:构建肾综合症出血热病毒核蛋白表达质粒PET32a(+)/Pn,在大肠杆菌中诱导表达并用亲和层析法纯化,运用array-ELISA方法鉴定重组蛋白的检测特异性,检测结果与商品化胶体金试剂盒进行比较.结果:在大肠杆菌中正确表达了肾综合症出血热病毒的核蛋白,亲和纯化得到较高纯度的蛋白质;
目的:了解诺如病毒引起的聚集性疫情的流行病学特点及传播途径,为采取有针对性的控制对策提供依据.方法:通过现场流行病学调查获得疫情发生的相关资料,运用描述性统计分析方法描述病例的症状和三间分布;采用细菌培养和RT-PCR检测病原体;用回顾性队列分析对传播途径进行验证性分析.结果:病例分布在6月4日至6月7日之间,均为三年级6班学生,共13例.患者的主要症状为呕吐占77%、腹泻占47%.实验室检测结果
目的:调查诺如病毒胃肠炎暴发疫情的特点及原因,探讨发病危险因素.方法:采用现场调查与病例对照方法,对疫情进行分析,提出有针对性的防控措施.结果:2014年9月21-28日,共报告胃肠炎病例37例,罹患率为4.4%,发病高峰为24日16:00时至25日8:00时,发病以一年级学生为主.病例对照研究结果显示在二楼餐厅就餐、在二楼午休房休息是发病危险因素.采集患者及厨工肛拭子、咽拭子、粪便及环境涂抹样本
目的:分析淄博市肾综合征出血热流行特征和变化趋势,为防控工作提供依据.方法:用描述性流行病学方法对全市疫情资料和宿主动物监测数据进行统计分析.结果:2006?2014年全市报告肾综合征出血热782例,死亡9例,平均发病率为1.96/10万,病死率1.15%,2011年以后发病率逐渐上升.发病以中老年农民为主,40?59岁年龄组占发病总数的51.41%.病例主要集中在淄川、博山、沂源地区,占全市病例
炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)是一种一种革兰氏阳性杆菌,它引起的炭疽是一种人兽共患的致死性传染病,严重危害人类的健康.炭疽芽胞感染宿主后在体内萌发、增殖,繁殖体经扩散后遍布整个机体,接着表达和分泌炭疽毒素,从而引起菌血症和毒血症,并最终致患者死亡.因此,了解炭疽杆菌感染宿主后在其体内的侵袭过程,对于炭疽病的的防治具有重要的意义.本文重点介绍了炭疽芽胞菌的感染过程,描述了可能的
巴贝虫病(babesiosis)由寄生于人红细胞的巴贝西原虫引起,是一种较新的、由蜱传播人兽共患病.临床表现有轻有重,典型的症状是在感染后1-4周出现,以发热、寒战、头痛、血小板减少、轻到重度的溶血性贫血为特征.全身症状包括乏力、不适、肌痛、厌食和嗜睡等,重症多见于老年和脾脏切除的患者.我国少有相关病例资料.现将一例被误诊为恶性疟原虫的巴贝西原虫感染病例进行报告.本病例有反复发热史,最高体温达40