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基于Landau-Ginzburg理论框架,在蛋白质中心碳原子上建立Frenet标架,利用其键角和扭转角的U(1)对称性提出了蛋白质体系的自由能和相应的孤子解,通过Glauber算法进行非平衡动力学模拟并搜索能量极小构型,然后重建全原子结构和优化构型空间。本研究中,我们采用与Fe65绑定的淀粉样前蛋白细胞内功能域(AICD)结构,基于上述方法,构建AICD的高精度两孤子模型并拟合参数,利用两孤子模型为初始构象进行升温和降温动力学演化。