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蛋白质组研究面临的一个重要问题是在复杂生物体系中不同种类蛋白质的含量相差巨大。如在血浆中蛋白质丰度分布超过10个数量级；高丰度蛋白质的含量占血浆总蛋白质的90％以上，而数以万计的低丰度蛋白质含量却低于10％。在这些低丰度蛋白质中往往包括一些在生命过程中起关键性作用的蛋白质，如功能调控蛋白、标记蛋白和药物的靶蛋白等。由于数量庞大、组成复杂、受高丰度蛋白质的掩盖、屏蔽作用影响，以现有的检测手段难以发现并分离鉴定大多数低丰度蛋白质已成为制约蛋白质组研究的瓶颈问题之一。因此，在复杂生物体系中去除多种高丰度蛋白质是解决该问题的有效途径。