重症肌无力患者胸腺组织非编码RNA差异基因及其靶基因的初步分析

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研究背景和研究目的:重症肌无力(myasthenia gravis,MG)是抗体介导、T细胞依赖的自身免疫性疾病。70%—80%MG患者存在胸腺增生、胸腺瘤等病变,多数患者胸腺中可见生发中心,从中能分离出分泌自身抗体的B细胞,切除胸腺症状好转,因此胸腺切除术成为治疗MG的重要手段。但迄今胸腺异常在MG发生发展中的机制尚不十分清楚,甚至胸腺在人类T细胞分化发育中的作用机制也存在许多未知,这些都有待更深入的研究。我们采用基因芯片技术,拟从中筛选出致病相关的基因,并通过一系列体外试验探讨其在疾病发生中的作用。方法和结果:试验组为临床症状典型、未长期使用免疫抑制剂和皮质激素治疗、年龄在16-25岁之间、胸腺切除后病理检查无胸腺瘤的重症肌无力患者;对照组为年龄与试验组相同、无自身免疫性疾病的心脏病手术患者。选择Agilent Human miRNA(8*60K)array对重症肌无力患者胸腺组织miRNA进行检测(上海伯豪生物技术有限公司进行)。该芯片来源于microRNA数据库(miRBase)21.0版本,覆盖2549个人类相关的miRNA,能特异性地检测出成熟的miRNA并能很好区分高度同源的miRNA分子。将miRNA芯片进行原始数据的归一化处理、聚类分析和miRNA表达差异筛选,从检测的2549个人类相关miRNA中筛选出差异表达miRNA,其中差异倍数(foldchange,fc)大于2和小于0.5的差异表达miRNA19个(其中fc>2的miRNA 5个,fc<0.5的miRNA 14个。通过生物信息学技术将MG患者和对照组胸腺组织差异表达的miRNA进行靶基因预测、靶基因功能分析和信号通路分析。从靶基因的GO富集结果和KEGG富集结果中enrich factor大于1.5者主要集中在跨膜受体丝氨酸/苏氨酸激酶信号通路、TGFβ受体信号通路、IκB和NF-κB信号通路、mRNA结合方面,这些通路均与JAK-STAT3通路高度相关。结论:重症肌无力患者胸腺组织存在多种miRNA的异常表达,可能通过丝氨酸/苏氨酸激酶信号通路、TGFβ受体信号通路、IKB和NF-KB信号通路参与胸腺细胞异常分化,并与疾病的发生发展相关。
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