基于LC-MS的代谢组学在乳腺癌标志物筛选中的应用

被引量 : 0次 | 上传用户:zhengwq1969
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
作为女性中最常见的恶性肿瘤,乳腺癌严重威胁女性健康。临床统计表明,早期发现的乳腺癌治愈率可达90%以上。因此,早期诊断意义重大,寻找灵敏度、准确度高的生物标志物尤为重要。代谢组学作为检测生物体内所有分子量小于1500的小分子的科学,直接体现了生物体表型~[1]。代谢重组作为癌症特征之一~[2],实时体现了癌症发生发展状态,加上代谢组学高灵敏的特点,使代谢组学成为标志物筛选的有力工具。本文基于超高效液相色谱-高分辨质谱(Thermo线性离子阱静电场轨道阱质谱)联用技术,对60例乳腺疾病患者的血清样品(28例乳腺癌患者,32例良性纤维瘤患者)进行代谢组学分析,通过主成分分析(PCA)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)等统计分析方法寻找乳腺癌和良性纤维瘤之间的代谢差异,最后通过ROC曲线考察差异代谢物对不同疾病的识别能力,找到9个潜在的生物标志物。在此基础上应用逻辑回归分析选取4种不同的化合物脯氨酸甜菜碱、苯丙氨酸、肉碱C14:0、亮氨酸-脯氨酸作为组合标志物进行进一步的曲线拟合,得到AUC值为0.82,具有较好的诊断能力。4种潜在生物标志物的发现为进一步临床验证提供了依据。
其他文献
本文综述了根癌农杆菌介导基因转化的一些最新研究进展,包括近几年来备受关注的参与农杆菌介导转化的相关植物编码因子的研究,标记基因的剔除方法,介导转化范围的扩展等。针对上
目的:分析我国Ⅰ类切口眼科手术预防性应用抗菌药物合理性。方法:采用病例回顾的方法,随机抽取卫生部全国抗菌药物临床应用监测网收集的2006~2007年全国113家医院Ⅰ类切口眼科
分析了维纳滤波原理和脉冲耦合神经网络(PCNN)模型的特点,根据斑点噪声统计模型的特征,结合小波变换方法,提出了一种基于PCNN模型的小波自适应斑点噪声滤除算法(W-PCNN-WD)来改善超声图像质量。首先,对超声图像进行对数变换,使斑点噪声转换为加性噪声;对医学图像进行维纳滤波处理,计算其加性噪声的标准方差,并以此作为小波阈值。然后,利用小波变换对图像进行预处理,利用PCNN在小波域中对小波系数