【摘 要】
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对柱花草炭疽菌致病力减弱突变菌株1681进行菌落生长速率、菌落形态及产孢量等生物学特性的研究,利用TAIL-PCR克隆标记基因侧翼序列,通过本地blast比对进行序列分析,采用生物
【机 构】
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海南大学农学院; 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所; 海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室; 海南大学旅游学院; 中国热带农业科学院热带
【基金项目】
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国家自然科学基金(31072076,31101408);公益性行业科研专项(201303057);中央级公益性科研院所基本科研业务专项(2015hzs1J002)资助
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对柱花草炭疽菌致病力减弱突变菌株1681进行菌落生长速率、菌落形态及产孢量等生物学特性的研究,利用TAIL-PCR克隆标记基因侧翼序列,通过本地blast比对进行序列分析,采用生物信息学方法进行基因预测及功能分析。结果表明,与柱花草炭疽菌野生型菌株CH008相比,突变菌株1681表现致病力减弱,生长速率(1.42±0.02)cm/d,与野生型(1.41±0.03)cm/d无显著性差异;产孢量(1.50±0.25)×10~6个/mL,显著低于野生型(9.26±0.14)×10~6个/mL;孢子萌发率(0.00±0.00)%,显著低于野生型(91.14±6.66)%;在分生孢子形态、附着胞形成等方面与野生型并无明显差异。TAIL-PCR扩增得到T-DNA插人位点RB端侧翼序列412 bp,LB端侧翼序列381 bp,经两侧序列拼接本地blast比对,与全基因组同源性为100%,进行生物信息学分析,预测T-DNA插入位点为基因起始外显子区域,ORF开放阅读框分析基因编码682个氨基酸,NCBI检索所得基因与炭疽菌基因Nara gc5苯丙氨酰.tRNA B亚基同源性为99%,将其命名为StCg-X1681,该基因序列属第二类氨酰基tRNA合成酶相似核心结构域超级家族。
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