山西省作为资源型经济转型综合配套改革实验区，矿区生态环境修复被纳入综改试验区建设的主要内容之一。然而，山西省在矿区生态退化及其修复治理方面的基础研究严重滞后，尚难为大规模矿区生态环境治理工程提供科学依据和技术支撑。基于此，旨在吸引和凝聚全国各地优秀科学家，重点解决山西省煤基低碳领域具有共性的重大科学问题和关键技术问题。国家自然科学基金委员会与山西省人民政府于2015年共同设立煤基低碳联合基金(以下简称NSFC-山西煤基低碳联合基金)。该基金重点确定了七个研究方向，矿区生态修复研究方向作为其中之一拟纳入2016年指南。因此，科学编制NSFC-山西煤基低碳联合基金之矿区生态修复研究指南，有针对性的分析山西省资源产业发展引起生态环境退化的成因、影响生态修复的限制因子和关键环节等相关科学问题，开展破坏方式、退化机理、修复治理技术、生态环境效应等相关基础研究，为山西省和国内类似矿区生态修复治理提供相应科学依据和技术支撑，具有重要战略意义和现实意义。本报告重点介绍研究指南凝练的思路、过程，重点关注的科学问题，以及指南包含的相关内容。