本研究在全基因组上对毛果杨WOX基因(PtrWOXs)家族进行综合分析，结果表明毛果杨基因组至少存在18个PtrWOX基因位点，包含2个WUSa、WOX1、WOX2、WOX4、WOX5、WOX9, 、WOX11/12，1个WOX6和3个WOXI3。根据保守的homedomain结构域，PtrWOXs分为现代(WUS)型、中间型和古老型三个亚家族。和拟南芥AtWOXs相比，PtrWOXs在基因结构、结构域、亚细胞定位十分保守，但是杨树WOX基因家族具有更加多样的表达模式，可能是因为杨树具有发达的次生生长而拟南芥没有。同时在毛白杨不定芽和不定根的形成过程中，部分PtoWOXs的表达呈现较高的动态和诱导型变化，表明PtoWOXs参与杨树的生长发育过程。通过对不同亚家族的PtoWOXs进行异位表达发现皆能促进不定根的形成，表明PtoWOXs调节杨树的生长发育可能通过相同的调节通路。进一步对PtoWOX11/12a功能进行分析，发现PtoWOX11/12a集中在根中转录，其表达模式受激素和环境条件的诱导，PtoWOX11/12a通过抑制TypeA-RR基因的转录，调控生长素运输蛋白的表达，从而调控植物体内生长素积累来促进不定根的形成。