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西方的科学和医学也开始探求系统性，从而和注重整体平衡的中医之间多了很多可以对话的渠道。近年来兴起的“系统生物学”是现代医学还原论思想从机械性思维发展到整合性、系统性思维的一种跨越。本文阐述了生命科学研究的发展趋势，探讨了中医药现代化研究的目的，并讨论了代谢组学、基因组学、各种数学计算方式以及哲学和其他人文学科与传统中医药学在研究相关复杂性疾病过程中的理念变化趋势。