交联蛋白鉴定软件pLink

来源 :中国化学会第二届全国质谱分析学术报告会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kingofking1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  交联质谱技术将质谱技术与交联技术相结合,为研究蛋白质的三维结构与蛋白质间的相互作用提供了新的技术手段。本课题组在前人工作的基础上研发了应用于化学交联技术的二肽交联鉴定软件系统pLink [1],并于2012年发表于Nature Methods 期刊。
其他文献
  化学药物治疗是肿瘤治疗的一种重要方式,它对许多不同种类的肿瘤都有一定的治疗效果,然而其毒副作用较大。因此,研制具有低毒副作用的肿瘤靶向药物日益成为肿瘤治疗的有效途
  恶性肿瘤已成为一类严重威胁人类健康和生命的疾病。对癌变组织代谢过程的研究有利于癌症早期诊断和治疗方法的开发。肿瘤组织的快速增长和细胞无限增殖需要摄取并消耗大
  膜蛋白质作为细胞内外的重要门户和枢纽,在外界物质识别,运输以及信号传导等方面具有举足轻重的作用,约三分之一的基因组参与膜蛋白的编码[1]。因此,深入的研究膜蛋白在机体
  内源性功能小分子(代谢产物)直接参与多个重要代谢通路和生物化学过程,这些代谢通路表达模式的改变与修正能够高灵敏地反馈机体对于疾病发生发展的代谢响应。大量研究证实
  目前,蛋白质鉴定广泛采用的方法是基于酶切肽段的串联质谱技术;最近五年多,高效的整体蛋白质分离技术和高分辨率的质谱技术的快速发展,使得研究人员开始采用基于整体蛋白
  受体膜蛋白是迄今为止最为重要的药物靶点蛋白,在美国FDA 认证的已知靶点蛋白的药物中,受体膜蛋白约占所有药物靶点蛋白的四成之多。受体膜蛋白的分子作用机制主要是调控细
  聚离子液体(离子液体的聚合物,PILs)是指在重复的单元上同时具备阴离子电解质和阳离子电解质组的高分子物质,即离子液体单体通过聚合产生的聚合物。其实人们在很早之前就
  蛋白质定量是蛋白质组学的重要研究内容,而定量数据解析是其中最关键的环节之一。我们开发了相关软件pQuant,主要支持基于一级谱图信息的标记定量实验,如SILAC标记实验、
  蛋白质的磷酸化(Post translational modification,PTM)是最丰富的翻译后修饰作用之一,调节着许多关键的生物体生命活动过程。这种可逆反应可能还会影响着蛋白质的3D结构
  通过质谱手段对磷酸化多肽的检测分析往往受限于磷酸化多肽/蛋白的低丰度和实际生物体系的复杂性。因此,开发高性能磷酸肽分离、捕获、富集材料,已成为解决这一难题的重