【摘 要】
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利用鸡的dbSNP数据库，在鸡一号染色体(GGA1)Contig.060226.1上一个200Kb的区域筛选了36个SNP标记.通过多态性检验，最终选取了多态性丰富的21个位点在红色原鸡(Red Jungle Fowl，RJF)、丝羽乌骨鸡(Taihe silk Chicken，TS)、隐性白洛克鸡(White Recessive Rock，WRR)三个群体中进行基因型定型.以r2为统计量，估算了
【机 构】
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华南农业大学动物科学学院,广州,510642;江西教育学院生物技术研究所,南昌,330029 华南
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利用鸡的dbSNP数据库，在鸡一号染色体(GGA1)Contig.060226.1上一个200Kb的区域筛选了36个SNP标记.通过多态性检验，最终选取了多态性丰富的21个位点在红色原鸡(Red Jungle Fowl，RJF)、丝羽乌骨鸡(Taihe silk Chicken，TS)、隐性白洛克鸡(White Recessive Rock，WRR)三个群体中进行基因型定型.以r2为统计量，估算了三个群体标记对之间的连锁不平衡值.相关性检验表明，红色原鸡(P=0.0154，R2=0.8928)、丝羽乌骨鸡(P=0.0041，R2=0.9491)的连锁不平衡值显著地随传递距离逐步递减;隐性白洛克鸡(P=0.2356，R2=0.4217)虽未达到显著水平，但也表现出逐步递减的趋势，其r2总变异方差的42％是由传递距离引起的.研究结果和Sved方程拟合状况良好.根据Sved方程，估算了鸡不同世代(short-or long-term)的群体有效规模大小(effective size of population，Nt).在鸡驯养的较早期阶段(t=960)，各品种的群体有效规模均在2500以上;在鸡驯养的较晚期阶段(t≤192)，各品种的群体有效规模渐趋稳定，含量约在600-800之间.如果本研究反映了鸡三个品种遗传结构的—般性，那么该研究对于鸡各品种特别是丝羽乌骨鸡的原位保存有重要的指导意义.
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以我国7个地方鸡种为研究对象，利用DNA测序技术测定了线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytoehrome coxidase Ⅰ CO Ⅰ)基因序列，探讨COⅠ这—特定基因的特定区段作为DNA条形码在识别地方鸡种方面的可行性和有效性.研究结果表明：选择的这段COⅠ基因序列有22个突变位点，为13个单倍型。其中11个单倍型为各品种所特有，可以作为各品种鉴定的依据;各鸡种在不同位点突变频率不同，6个鸡种
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