【摘 要】
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本研究基于MiSeq高通量测序的方法研究高精料日粮对锦江黄牛瘤胃细菌多样性及菌群结构的影响.选取3头装有永久性瘤胃瘘管的锦江黄牛公牛(体重400±20kg),采用自身对照法,分为2个阶段进行.第一阶段日粮精粗比为2∶8(低精料组,HF);第二阶段日粮精粗比为8∶2(高精料组,HC).采集瘤胃液样品,测定瘤胃pH,提取DNA,对细菌的16S rDNA序列V4-V5区进行MiSeq高通量测序.结果表明
【机 构】
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江西农业大学江西省动物营养重点实验室/营养饲料开发工程研究中心,江西南昌330045
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本研究基于MiSeq高通量测序的方法研究高精料日粮对锦江黄牛瘤胃细菌多样性及菌群结构的影响.选取3头装有永久性瘤胃瘘管的锦江黄牛公牛(体重400±20kg),采用自身对照法,分为2个阶段进行.第一阶段日粮精粗比为2∶8(低精料组,HF);第二阶段日粮精粗比为8∶2(高精料组,HC).采集瘤胃液样品,测定瘤胃pH,提取DNA,对细菌的16S rDNA序列V4-V5区进行MiSeq高通量测序.结果表明,高精料日粮降低了锦江黄牛瘤胃pH,诱导产生了SARA.同时,还降低了瘤胃细菌的多样性.在门水平上,高精料日粮增加了瘤胃中Bacteroidetes(拟杆菌门)的相对含量(P<0.1),降低了Spirochaetes(螺旋菌门)的相对含量(P<0.1).在纲水平上,增加了Bacteroidia(拟杆菌纲)的相对含量(P<0.1),减少了Spirochaetes(螺旋菌纲)的相对含量(P<0.1).在科水平上,显著增加了Prevotellaceae(普雷沃氏菌科)的相对含量(P<0.05),减少了Lachnospiraceae(毛螺菌科)的相对含量(P<0.1).在属水平上,显著增加了Prevotella(普雷沃氏菌属)的相对含量(P<0.05),Paraprevotella(帕拉普氏菌属)、Ruminococcus(瘤胃球菌属)、Treponema(密螺旋体属)、Sporobacter、Victivallis(食物谷菌属)和Hallella的相对含量显著减少(P<0.05).高精料日粮可降低瘤胃pH值,导致瘤胃菌群紊乱.
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